(👷)第二集中，尼(🥇)奥（基努(nǔ )·(🍩)里(lǐ )维(wéi )(🌰)斯 Keanu Reeves 饰）没有(🛤)能从内部(bù )(🏴)摧(cuī )毁“母(mǔ )体”，他(tā )的身体在(🎏)真实世界的飞(fēi )(😎)船上陷于(🐿)昏迷，思想(xiǎng )却被困在介于“母体(✳)”和(hé )真(zhēn )(🛹)实世界的中间地(dì )带，这(zhè )个地方由(yóu )“火(huǒ )(😻)车(chē )人”控制(zhì )。墨(mò )菲(😱)斯(sī )（劳(🔊)伦斯(⏺)·菲(fēi )什(shí )伯恩(🚣) Laurence Fishburne 饰）和(hé )崔妮蒂（凯(kǎi )瑞-安·莫斯 Carrie-Anne Moss 饰(😍)）等(👺)人(⛳)知道(dào )了尼奥的(de )情况，在守护天使的带领下， 找(zhǎo )到了“火车(🛎)人”的控制(😊)者梅罗纹奇，经过(👪)一番激(🃏)斗，将尼奥救了(🐩)出来。　　此时，电子乌贼(🔤)部队对锡安发起了猛烈(🐞)的攻击，人(rén )类(📐)组织(🌂)所(suǒ )有机甲(🐖)战(🆙)士展开顽强的抵抗，形(🚽)势危在旦(👛)夕；尼奥和崔妮蒂驾驶了一艘飞船克服(fú )重重困难，到(dào )达机器(qì )城(⛴)市(shì )，尼奥终于见到了机(jī )器(qì )世(shì )界的统(tǒng )治者“机器大帝(👼)”，双方(🏡)谈判并(🈸)达(dá )(🙅)成了(🛌)协议：尼(ní )奥除掉不(👆)受“母体”控(kòng )制的史(shǐ )密斯，以(🐸)换(huàn )取锡安(ān )(👔)的和平。　　在“母体”中，尼奥(👧)和(🐼)史(shǐ )密斯(sī )(🥈)展开了关系人类(🎇)生死存亡的最后决斗(dòu )。