ある(🆓)日、(✒)沖(chòng )(🐽)縄の海に(🏽)奇怪(🍩)な生物が(🕋)現(😘)れた。オ(🔱)ニヒ(🤢)トデを思わ(🎗)せる「それ」は毒(dú )液で漁師を負傷(🎾)させ、瞬く間に日本全域に広(guǎng )がった。それは伝説の(🛍)ニ(🎡)ライカナイの古代文明が(🏐)環境汚染の解決(jué )(🎫)の為の生(🍮)体浄化システム(🐶)として生み出したが、暴走したために(🌚)結果としてニ(🖲)ライカナ(🦗)イの滅亡の一(🥔)因となっ(📙)た怪獣ダ(🏂)ガ(🙌)ーラの復活の前兆(🙉)で(💪)あっ(🎾)た。　　エリアス(⛳)姉妹(💠)は地球の(🤳)危機を察(chá )知して石垣島へ飛(👣)ぶと、そこにはニライカナイから来た小生物ゴーゴ(⛏)が出現(xiàn )し、その尾の装(💹)飾リングか(🔈)ら(🏒)宝がある(🐡)事を悟った本土からの密猟者と、ゴーゴ(🥅)を保護した地元(yuán )の少女たちが(🐖)いた。エリアス姉妹は「ニラ(🍁)イカナイの遺跡にはダガーラを倒す秘宝(🤼)がある」という伝説を知って(❄)いた。少女たち(🈳)と(🐈)エリアス姉妹、そして(🖱)姉(zǐ )妹と対(duì )(🐅)立する黒い妖(🙅)精ベルベラと(🚓)密猟者はそれぞれ組んで海へ出る。　　ゴーゴの手引(🍏)きでニ(⏭)ライカナイ(🖥)の遺(😙)跡であるピラミッ(📸)ドが海から出(🎆)現した。だが、宝捜しをしてい(❗)る頃(😓)、(🔚)石垣島にダガーラが上陸し(🦀)暴れ(➿)出(chū )したため、エリアス姉妹はモスラを召(zhào )喚(huàn )し(🛒)て(🤟)戦(🏫)いを挑(tiāo )む。ダガ(🐊)ー(😎)ラ(🙂)とモ(🌥)スラは石(shí )垣(yuán )島から西表(🚞)島まで空中(🖨)戦を繰り広げ、遺(yí )跡のピラミッ(Ⓜ)ド付(💙)近(jìn )(☔)で海中戦となり、モスラは海での戦いを得意とするダ(🎅)ガーラに海に(🈲)引きずり込ま(🤺)れた。そしてダガーラは「それ(🏰)」 = 無数のベーレムをモスラに取り付(🖌)かせ、モス(🕳)ラ(💃)は戦闘(⤴)不(bú )能に陥った。エ(😀)リ(🔝)アスは必(bì )死にモスラ(☕)に取り付(🤼)いたベーレムを剥がそうと試みる(🚇)が、あまりにも沢山付いているため、全くきりが(🔅)ない。絶体(👻)絶命のピ(📓)ンチに陥(xiàn )ったモスラ、宝の(📐)発見(jiàn )は急務となった。　　遺(yí )跡の中のトラッ(🕰)プをく(🍚)ぐり抜けた(🔔)少(shǎo )女たちと(🎷)密猟者(🐂)は、辿(chān )りついた(🐋)ホールでニライカ(🗂)ナイの王女(nǚ )の立体映像(xiàng )(🔦)か(🍝)ら(🐻)「ゴー(🧜)ゴ(🔢)が宝(🍺)の主として少女 = 汐(xī )里を選んだ」事を告げられる。だが、ダ(🚱)ガーラはピラミッドを襲撃してき(🎯)た! 崩壊(huài )するピラミ(🥪)ッドの最中、モスラはゴーゴの「命の(❤)水」の力により、取り付いたベー(👥)レ(🖱)ムは(♟)取り払われ(🛵)、さらにレイン(✨)ボーモスラと(🖐)なってパワーア(👵)ップし、再(🥇)びダガ(🚴)ーラと再(zài )戦する。さ(😾)っきま(😐)での状況とは一変(✝)し、今(🌳)度はモ(🖇)スラが優位(wèi )(⛲)に立った。ダガ(📣)ーラが再び海中(🕕)に潜(🆔)った(🕥)時(shí )、モスラはアク(🈵)アモスラ(😱)に変(⛵)身し(🦑)、戦いの舞台は、海底(😼)に移った。ダガ(📴)ーラの(🕶)攻撃をバリア(➿)ー(㊗)でガードし(🗑)、ダ(♎)ガーラに強(🕥)力な(🤚)攻撃を与える(📛)モスラ。さ(🖍)らに分(fèn )身モード(🅰)となり、ダガーラ(🆚)の体内から、ベーレ(👭)ムを倒(dǎo )(🌈)しな(💬)が(🚳)ら攻撃し、遂にダガーラは倒れ、その後、ピラミッドと(🛹)共に消滅(🌥)。モスラも(🕣)海から出てきた後、元の姿(🕶)のレインボーモスラに戻(🛴)り、インファント(📕)島に帰って行(👀)き(💡)、(⏭)危機は去った(📖)のであった。